Naruto raconte l'histoire de Naruto, un enfant âgée de douze ans et qui rêve de devenir Hokage enfin d'être reconnu de tous les habitants du village. En effet. juste avant sa naissance un démon renard à neuf queux attaqua son village et le démon fut sceller dans le corps de Naruto qui entraine donc le mépris et la peur des villageois. Malgré cela, Naruto s'entraine très fort pour devenir genin, premier niveau chez les ninjas. Après avoir raté l'examen genin trois fois, il réussit à devenir ninja. Il est alors inclus dans une équipe de trois apprentis ninja avec Sakura Haruko et Sajuke Uchiwa sous la supervision du jonin Kakashi Katake. Et puis l'histoire commence réellement. Le récit peut grossièrement être découper en deux grandes parties. La première partie se passe du premier chapitre au chapitre 238. La seconde partie se passe du chapitre 239 à la fin. Évidement un découpage plus fin en différent arc scénaristique existe.
Naruto a été très bien accueillit au Japon et aux États-Unis ainsi que dans le reste du monde. Naruto est l'un des plus grands succès de Viz media, son éditeur aux États-Unis. La série à reçu beaucoup d'éloge de la part des critiques et de plusieurs sites web spécialisé en manga, l'anime ou le jeux vidéo. Ainsi, on note que certains volumes se concentre sur certain personnage, augmentant leur popularité auprès des fans. La combinaison entre scène de combats, scène humoristique et les bonnes illustration sont aussi à noté. Cependant, certains critique le personnage de Naruto comme étant irritant. Le design des personnages est aussi critiquer positivement puisque chacun à une personnalité et une apparence unique, les personnages au style extravagant pouvant agir de manière très cool au combat. Toutefois, le nombre de scène de combats est critiquer puisque ralentissent le bon déroulement de l'histoire, bien que chaque bataille apporte son lot l'émotion. La série a également été saluer pour sa lecture toujours agréable et les antagonistes. Les illustrations de Kishimoto rendent l'histoire dramatique et excitante. Le début de la partie II a également été salué, les personnages ayant évolué avec leur nouvelles apparence et habileté. L'équilibre entre les scènes d'actions et d'intrigue permet d'apprécier l'histoire. On note toutefois que les volumes ne sont pas tous de la même qualité. À partir de la partie II, le manga est plus adulte depuis que les personnages ont grandit, bien les scènes comique soient toujours présente. La traduction anglaise de Viz Media est quand à elle décrié pour son incohérence envers certains terme japonais. Ainsi certains termes sont traduits, mais d'autre non.
Tous les deux à trois mois, un nouveau recueil de deux cents pages environ, regroupant en moyenne neuf des chapitres précédemment publiés dans le magazine, est publié par l’éditeur japonais. La version francophone et néerlandophone sont publié directement sous la forme de tome relié par l'éditeur Kama et ce depuis 2002. Ces versions sont ensuite distribué en France, en Belgique, au Luxembourg, aux Pays-Bas, au Québec et en Suisse. En 2012, à l'occasion des 10 ans de Naruto, les éditions Kana ont édité les huit volumes collector réalisés par l'éditeur original au Japon pour la même occasion. Publiés en édition limitée et accompagnés de nombreux goodies, ils rassemblent les tomes 1 à 27 de la série au format original japonais, 178 x 258 mm.
Au Canada, aux États-Unis et au Royaumes-Unis, l'éditeur Vix Media publie le manga depui août 2003 dans la collection Shonen Jump grapic novel. L'éditeur anglophone a d'ailleur publié plusieurs livres en rapport à la série tel que des artbook et des novélisation. En Espagne, la filiale espagnol de l'éditeur Glanat devenus par la suite indépendant sous la nom de Editores de Tebeos commença la publication du manga en 2002 et ce en espagnol et en catalan. En raison du non renouvellement du droit d'exploitation, l'éditeur doit arrêter la publication après le tome 60 c'est par la suite l'éditeur Planeta DeAgostini et sa filliale bande-dessiné PlanetaDeAgostini Comics qui reprend la publication et réédite les volumes épuisé.
