Je vais vous donner mon explication à moi ( qui vaut ce qu'elle vaut ) et qui pourrait correspondre au cheminement mental de Kurumada lorsqu'il a inventé ce navire ...
Tout le monde aura remarqué les allusions claires à la divine comédie dans le chapitre des enfers. Les chevaliers plongent dans les enfers, qui semblent être un monde souterrain ( ou une dimension à part ) et qui sont calqués sur les enfers de la divine comédie de Dante.
Or il se trouve que dans Saint Seiya si les enfers ressemblent fortement aux enfers de Dante, avec en gros la partie des prisons qui correspond à l'enfer proprement dit, et les sphères finales ( Toloméa, caina,Anténora et Giudeca + cocite ) qui correspondraient au purgatoire, le lieu où se trouve Lucifer chez Dante ( remplacé dans saint seiya par le trône d'hadès ) en revanche le paradis de Saint seiya évoque beaucoup plus le paradis de la mythologie grecque : les champs Elysées, et c'est le mur des lamentations ( et le vortex) qui permet de passer de l'un à l'autre. les 2 semblent être comme dans une dimension à part de l'univers , reliée par un vortex , un peu comme un trou de ver.
Or chez Dante dans la divine comédie, le paradis est lui-même constitué de sphères ( comme les enfers divisés en sphères / équivalent des prisons dans saint seiya )
Les sphères du paradis sont au nombre de 9 et elles sont dirigées vers le haut ! ( en l'occurence ... le ciel !! si on veut ! ) Le paradis est construit à l'inverse des enfers !
Voici une illustration du peintre français
Gustave Doré encore lui (peintre dont beaucoup de plans du chapitre des enfers de saint seiya s'inspirent),
L'illustration représente ici une scène de la divine comédie où Dante et Béatrix (sa muse) observent le paradis :
Vous devez déjà remarquer une ressemblance assez frappante avec le Lost Canvas ( la peinture céleste d'Hadès dans le manga saint seiya Lost Canvas ! )
Ce qu'il faut dire aussi c'est que chaque sphère du paradis dans la divine comédie
correspond à une planète 
!! On a ainsi le
ciel de la lune, le
ciel de Mercure, le
ciel de Vénus etc !! Vous voyez évidemment où je veux en venir.
Une page web qui en parle :
http://docteurjp.free.fr/dante/paradis.htmVoici comment sont décrits les différents ciels :
1er ciel : Ciel de la lune - Esprits qui ont manqué à leurs vœux
2ème ciel : Ciel de Mercure - Esprits actifs et bienfaisants
3ème Ciel : Ciel de Vénus - Esprits aimants
4ème Ciel : Ciel du Soleil - Docteurs et Théologiens
5ème Ciel : Ciel de Mars - Chevaliers de Christ
6ème Ciel : Ciel de Jupiter - Princes justes et sages
7ème Ciel : Ciel de Jupiter - Esprits contemplatifs
8ème Ciel : Ciel des étoiles - Triomphe du Christ et de la Vierge
9ème Ciel : Premier Mobile - Hiérarchie Angélique
Je recopie aussi ce que nous raconte le site web cité plus haut à propos de la structure :
Les 9 chœurs des anges apparaissent à Dante comme des cercles lumineux qui tournent autour d'un point éblouissant, image de Dieu. Les chœurs sont les intelligences motrices des 9 ciels Le premier mobile reçoit directement directemment de l'Empyrée le mouvement qu'il transmet aux autres ciels.
ce sujet est passionnant et il me fait digresser avec bonheur, il faudra qu'on en fasse un topic à part ...
Tout ça me laisse penser qu'en réalité, le Lost Canvas était peut-être une idée déjà en gestation dans l'esprit de Kurumada dès les années 80 !
Je pense que lorsque Kurumada a commencé à inventer et dessiner le chapitre du Meikai, il voulait non seulement décrire toutes les prisons, tous les spectres, et faire quelque chose de beaucoup plus complet et encore beaucoup plus proche de la divine comédie, exploitant un peu chaque allusion, mais il avait probablement aussi une autre vision du paradis, une vision plus conforme à celle de la divine comédie.
Une sorte de paradis céleste qui aurait sans doute été situé en hauteur, de même que les enfers sont un peu situés dans une sorte de monde souterrain, et je pense qu'il avait peut-être en tête d'exploiter le navire de Jamir, pour permettre aux chevaliers de rejoindre le ciel, autrement dit le paradis, un peu comme Dante dans la divine comédie, et c'est grosso modo le rôle que joue le navire de Jamir dans Lost Canvas quand les chevaliers d'athéna rejoignent les différentes planètes. C'est un peu ma théorie, j'avoue que je rêverais de poser un jour cette question à Kurumada (si un jour il vient en France et que j'ai la chance d'assister à une conférence, c'est l'une des questions phares que je lui poserais car l'idée m'obsède
) Après peut-être que je me trompe mais la présence de ce navire sur la couverture kana m'intrigue d'autant que shiori réutilise ça, et que les planètes chez Shiori est une sorte d'exploitation de la partie de la divine comédie que Kurumada n'avait pas exploité, comme si les deux (saint seiya classique et saint seiya Lost Canvas) s'emboitent pour nous donner une parabole complète de l'oeuvre de Dante.
Si cette théorie est juste, le paradis aurait sans doute beaucoup ressemblé au paradis de la peinture de Gustave Doré, et donc, au Lost canvas, la peinture céleste du manga de Shiori, avec sans doute des planètes (temples) et des combats à l'intérieur, des combats nombreux sans doute, contre beaucoup d'adversaires .. des spectres ? des divinités comme thanatos ou Hypnos ?
Quelque chose semble avoir fait changer d'avis Kurumada qui a finalement écourté son récit pour nous pondre cette fin de chapitre Hadès téléphoné où tout sonne bizarre, il voulait sans doute en finir plus vite pour plein de raisons (et je le regretterai éternellement) Peut-être une lassitude de dessiner du saint seiya pendant des années, ou l'impression qu'il fallait qu'il parte sur un scénario un peu différent, en se ramenant à quelque chose évoquant plus la mythologie grecque qui baigne constamment l'oeuvre (le paradis d'Elision qu'on connait, et les dieux Hypnos et Thanatos, c'est une vision assez familière du Paradis) Je pense que c'est à ce moment là qu'il a abandonné l'idée d'exploiter le navire de Jamir, comme moyen de transport pour aller des enfers au paradis, et qu'il l'a sans doute remplacé par le mur des lamentations, et le vortex .. Abandonnant du même coup l'idée du paradis céleste et des planètes, il a du "recycler" l'idée des 9 planètes à travers l'alignement (c'est une autre de mes hypothèses), et l'invention de l'ultime éclipse. A moins que cette histoire était déjà présente dans son scénario de base, s'emboitant dans l'ensemble de manière cohérente. Quoiqu'il en soit cette fin de chapitre Hadès me laisse d'amers regrets, car il y avait des idées géniales à exploiter, et Kurumada semble les avoir frôlé ..
Beaucoup plus tard, lorsque Shiori s'est lancé dans l'aventure Lost Canvas, Kurumada l'aidant dans son travail, je pense qu'il a du lui parler de cette histoire, qu'elle a tenté de recycler à sa manière , en fonction de son propre récit. Autrement dit, je pense qu'il y a beaucoup plus de Kurumada qu'on le pense dans Lost Canvas, un peu comme si toutes les idées que Kuru avait en tête mais qu'il a abandonné en racourcissant son histoire, pour terminer plus vite, dans les années 80, avaient été un peu reprises ;
c'est comme-ci la divine comédie existait pour moitié dans l'histoire kurumadienne à travers l'évocation des enfers, et pour moitié dans l'histoire shiorienne à travers l'évocation des planètes et du Lost Canvas !!!
Moi qui aime la divine comédie, j'avoue que je n'avais jamais fais attention aux histoires de planètes pour le paradis, j'étais plus concentré sur la partie infernale, du coup, je trouve beaucoup plus logique qu'à une époque, le fait que Shiori n'ait pas développé une grosse bataille dans les enfers comme Kuru, mais qu'elle ait porté la bataille finale dans le ciel ; Au début je me demandais pourquoi elle avait eu cette idée saugrenue, car j'associe Hadès aux enfers donc au monde souterrain et un chapitre Hadès sans voir les enfers (ou aussi peu qu'on les voit dans Lost Canvas) pour moi ça ne tenait pas debout, et là on avait une bataille finale d'un chapitre contre Hadès se déroulant dans le ciel (que j'associe plus souvent à Zeus ou à d'autres olympiens) et je trouvais le scénario de Shiori absurde et téléphoné du coup, comme si elle avait simplement cherché à changer pour pas qu'on l'accuse de plagiat, mais selon ces considérations, il y a quelque chose de logique dans le scénario de Shiori, une logique ... kurumadienne peut-être !!
Du coup, je vois maintenant les choses un peu différemment, et je pense aussi par corollaire que les 2 auteurs travaillent beaucoup plus ensemble qu'on peut le penser, ils doivent échanger souvent des idées. Ils ont du beaucoup se parler, au moins au début.
) que l'on voit sur la couverture du numéro 24 des manga Kana de Saint Seiya ? (le volume qui correspond en gros ** spoiler ** à Orphée et Eurydice, Pharao, Shun possédé par Hadès et les combats avec kanon shiryu et hyoga dans les prisons 3,4 et 5 ..** )
! il n'y a pourtant pas de bateau dans l'histoire, alors est-ce que Kurumada avait d'autres idées en tête quand il a commencé a écrire ce volume (on sait un peu qu'il a un peu baclé la fin du chapitre Hadès malheureusement, c'est perceptible quand on lit la partie Elysion mais aussi quand on voit les nombreuses prisons des enfers qu'il a zappé ... ) avait il prévu un truc qu'il n'a jamais dessiné ???
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Ce navire aurait servi pendant les guerres saintes antérieures et il semble être un petit clin d'oeil à l'arche de Noé dans la Bible. 
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d'ailleurs dans ma tentative de fanfic (ma "presque fanfic" avortée dont je parle toujours mais qui n'existera jamais 