L'anime est très court puisque seulement deux épisodes ont été produit avant que l'anime soit annullé. Les deux épisodes couvrent ensemblent les trois premiers du jeu, sur 49! Comprenez donc que l'anime ne va pas très loin dans l'histoire. L'anime se terminant sur l'arrivé de l'armée Althéenne au frontière du royaume d'Orléans
Le pontife Gharnef a réssuciter le dragon des ténèbres Medeus, vaincu il y a cent ans de cela par le premier roi d'Altea Anri, le Grand armée de l'épée divine Falchion. Medeus recrée alors l'empire de Dolhr et s'allie à Gharnef et ensemblent, commencèrent la planification de la conquête du monde connu. S'alliant aux royaumes de Grust et Macedon, Gharnef attaque le royaume d'Altea au nom de Medeus. Gràce à la trahison du royaume de Gra, Altea tombe et le roi Cornelius meurt. Gharnef s'empare alors de Falchion. Le prince d'Altea, Marth et sa soeur Elice tentent alors de s'échapper avec le chevalier Jagen. Toutefois, sur le point d'être capturer, Elice décide de se sacrifier et téléporte Marth et Jagenleur permettant de s'échapper, mais est alors capturer par les soldats de Gharnef.
Deux an plus tard, Marth vit en exile au royaume insulaire de Talys, développant une forte amitié avec la princesse du royaume, Caeda. Alors qu'à l'extérieur de l'île le monde semble sombrer dans les ténèbres. Le Saint-Royaume d'Archenea a été conquis par Medeus qui extermina la famille royal. Seul la princesse Nina réussis à s'échapper gràce aux exploits du général Camus, celui même qui conquis le royaume. Gharnef a quand à lui vaincu le pontife d'Archenea Miloah et et prit le contrôle de Khadein, la cité des magiciens. Les royaumes s'oppossant au règne de Medeus tombent les uns après les autres, seul les royaume d'Aurelis et de Talys n'ont pas encore été conquis. C'est alors que les pirates de Galder attaque le royaume de Talys réussissant à capturer Mostyn, le roi de Talys. Caeda réussit à s'échapper et préviens Marth et les chevalier d'Altea. Le jeune prince décide alors de protéger ceux qui l'ont héberger et attaque les pirates. Selon lhevalier d'Altea Jagen, cette action va inévitablement révéler l'existance du jeune prince au monde. Ayant réussis à repousser l'attaque des pirates, Marth décide qu'il est finalement suffisament prêt à défaire Medeus. Il part alors avec les derniers chevaliers d'Alteas, la princesse Caeda ainsi que quelque soldats de Talys vers le royaume d'Aurelis pour rejoindre la princesse Nina.
Un ans après la sortie des épisodes au Japon, l'anime sort en Amérique du Nord en VHS, doublé et sous-titré en anglais.
Il est d'ailleurs étrange que l'anime sort en Amérique du Nord, inachevé alors que le jeu vidéo qu'il adapte soit rester au Japon. Surtout quand l'on pense que c'est donc le premier produit officiel de la série à sortir en dehors du Japon. D'ailleurs puisque l'anime est sortis bien avant que tout produit de la série Fire Emblem sorte du Japon, la traduction de plusieurs noms est très différente avec les noms officiels adopter plus tard par Nintendo. Ainsi,le personnage principal Marth garde son nom japonnais, soit Mars. La première apparition de Marth sous le nom...Marth en occident étant dans Super Smash Bros Melee en 2001.
. 
